MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_2p

Total Repeats: 6211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016591	CGTG	2	8	1573	1580	0 %	25 %	50 %	25 %	377807002
2	NC_016591	CTG	2	6	1586	1591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807002
3	NC_016591	GC	3	6	1643	1648	0 %	0 %	50 %	50 %	377807002
4	NC_016591	GATGCC	2	12	1658	1669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	377807002
5	NC_016591	GCG	2	6	1700	1705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807002
6	NC_016591	GTG	2	6	1724	1729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807002
7	NC_016591	GCG	2	6	1737	1742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807002
8	NC_016591	CAC	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807002
9	NC_016591	TCG	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807002
10	NC_016591	GACT	2	8	1904	1911	25 %	25 %	25 %	25 %	377807003
11	NC_016591	CCT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377807003
12	NC_016591	GCG	2	6	2062	2067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807003
13	NC_016591	GCG	2	6	2135	2140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807003
14	NC_016591	CG	3	6	2145	2150	0 %	0 %	50 %	50 %	377807003
15	NC_016591	TTC	2	6	2158	2163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807003
16	NC_016591	CGA	2	6	2174	2179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807003
17	NC_016591	CTT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807003
18	NC_016591	CCG	2	6	2501	2506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807004
19	NC_016591	G	6	6	2633	2638	0 %	0 %	100 %	0 %	377807004
20	NC_016591	ACCG	2	8	2703	2710	25 %	0 %	25 %	50 %	377807004
21	NC_016591	CGT	2	6	3297	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807005
22	NC_016591	ATC	2	6	3306	3311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807005
23	NC_016591	GAC	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807005
24	NC_016591	GCT	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807005
25	NC_016591	TC	3	6	3417	3422	0 %	50 %	0 %	50 %	377807005
26	NC_016591	ACC	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807006
27	NC_016591	CGC	2	6	4288	4293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807006
28	NC_016591	AGA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807006
29	NC_016591	GAA	2	6	4417	4422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807006
30	NC_016591	CGA	2	6	4479	4484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807006
31	NC_016591	CGA	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807006
32	NC_016591	GCGA	2	8	4562	4569	25 %	0 %	50 %	25 %	377807006
33	NC_016591	CG	4	8	4593	4600	0 %	0 %	50 %	50 %	377807006
34	NC_016591	GGC	2	6	4637	4642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807006
35	NC_016591	GAT	2	6	4654	4659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807006
36	NC_016591	GAA	2	6	4675	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807006
37	NC_016591	GCA	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807006
38	NC_016591	ACG	2	6	4715	4720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807006
39	NC_016591	GAA	2	6	4762	4767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807006
40	NC_016591	GAA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807006
41	NC_016591	GCGGT	2	10	4872	4881	0 %	20 %	60 %	20 %	377807006
42	NC_016591	TGC	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807006
43	NC_016591	GAA	2	6	4954	4959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807006
44	NC_016591	ACC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807006
45	NC_016591	AGAA	2	8	5063	5070	75 %	0 %	25 %	0 %	377807006
46	NC_016591	CGA	2	6	5103	5108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807006
47	NC_016591	GCGAC	2	10	5163	5172	20 %	0 %	40 %	40 %	377807006
48	NC_016591	CGCC	2	8	5259	5266	0 %	0 %	25 %	75 %	377807006
49	NC_016591	AGA	2	6	5295	5300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807006
50	NC_016591	CCACGA	2	12	5302	5313	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	377807006
51	NC_016591	GCC	2	6	5332	5337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807006
52	NC_016591	GCG	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807006
53	NC_016591	ACG	2	6	5529	5534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807006
54	NC_016591	ACG	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807006
55	NC_016591	CAG	2	6	5545	5550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807006
56	NC_016591	AGCC	2	8	5594	5601	25 %	0 %	25 %	50 %	377807006
57	NC_016591	GGC	3	9	5626	5634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807006
58	NC_016591	TGA	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807006
59	NC_016591	TCG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807006
60	NC_016591	CGA	2	6	5716	5721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807006
61	NC_016591	GCC	2	6	5779	5784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807006
62	NC_016591	GCG	2	6	5790	5795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807006
63	NC_016591	GAT	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807007
64	NC_016591	GTC	2	6	5967	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807007
65	NC_016591	CG	3	6	6004	6009	0 %	0 %	50 %	50 %	377807007
66	NC_016591	CATC	2	8	6022	6029	25 %	25 %	0 %	50 %	377807007
67	NC_016591	GCA	2	6	6139	6144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807007
68	NC_016591	CCG	2	6	6166	6171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807007
69	NC_016591	GCG	2	6	6322	6327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807007
70	NC_016591	GCG	2	6	6362	6367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807007
71	NC_016591	CG	3	6	6366	6371	0 %	0 %	50 %	50 %	377807007
72	NC_016591	GC	3	6	6404	6409	0 %	0 %	50 %	50 %	377807007
73	NC_016591	CGG	3	9	6439	6447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807007
74	NC_016591	TCGA	2	8	6468	6475	25 %	25 %	25 %	25 %	377807007
75	NC_016591	CGGT	2	8	6480	6487	0 %	25 %	50 %	25 %	377807007
76	NC_016591	GCG	2	6	6540	6545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807007
77	NC_016591	CG	3	6	6556	6561	0 %	0 %	50 %	50 %	377807007
78	NC_016591	GCG	2	6	6611	6616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807007
79	NC_016591	GTT	2	6	6683	6688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377807007
80	NC_016591	GCT	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807007
81	NC_016591	CGG	2	6	6763	6768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807007
82	NC_016591	GAC	2	6	6779	6784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807007
83	NC_016591	GTC	2	6	6812	6817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807007
84	NC_016591	CGT	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807007
85	NC_016591	CGT	2	6	6914	6919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807007
86	NC_016591	GTA	2	6	6920	6925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807007
87	NC_016591	GCC	2	6	6929	6934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807007
88	NC_016591	CGC	2	6	6943	6948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807007
89	NC_016591	CGATCG	2	12	6949	6960	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	377807007
90	NC_016591	CGC	2	6	6962	6967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807007
91	NC_016591	AGC	2	6	6969	6974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807007
92	NC_016591	AGC	3	9	6978	6986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807007
93	NC_016591	CGG	2	6	7012	7017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807007
94	NC_016591	GCG	2	6	7108	7113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807008
95	NC_016591	GCC	3	9	7140	7148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807008
96	NC_016591	CTG	2	6	7170	7175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807008
97	NC_016591	CG	3	6	7269	7274	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
98	NC_016591	TGC	2	6	7294	7299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807008
99	NC_016591	GC	3	6	7298	7303	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
100	NC_016591	GCG	2	6	7309	7314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807008
101	NC_016591	CGA	2	6	7334	7339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807008
102	NC_016591	GA	3	6	7366	7371	50 %	0 %	50 %	0 %	377807008
103	NC_016591	GC	4	8	7460	7467	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
104	NC_016591	CGC	2	6	7472	7477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807008
105	NC_016591	CCG	2	6	7508	7513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807008
106	NC_016591	CGC	2	6	7527	7532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807008
107	NC_016591	GC	3	6	7650	7655	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
108	NC_016591	CGA	2	6	7658	7663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807008
109	NC_016591	GCG	2	6	7671	7676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807008
110	NC_016591	CGG	2	6	7688	7693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807008
111	NC_016591	GC	3	6	7740	7745	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
112	NC_016591	AGC	2	6	7777	7782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807008
113	NC_016591	ACG	2	6	7804	7809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807008
114	NC_016591	CG	3	6	7836	7841	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
115	NC_016591	CGG	2	6	7862	7867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807008
116	NC_016591	CCG	2	6	7910	7915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807008
117	NC_016591	CG	3	6	7981	7986	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
118	NC_016591	CG	3	6	8002	8007	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
119	NC_016591	CGG	2	6	8072	8077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807008
120	NC_016591	ATA	2	6	8129	8134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377807008
121	NC_016591	CGG	3	9	8169	8177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807008
122	NC_016591	CGAGTA	2	12	8208	8219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	377807008
123	NC_016591	GC	3	6	8230	8235	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
124	NC_016591	GCA	2	6	8237	8242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807008
125	NC_016591	CGC	3	9	8274	8282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807008
126	NC_016591	GC	3	6	8286	8291	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
127	NC_016591	TCG	2	6	8329	8334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807008
128	NC_016591	AGC	2	6	8335	8340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807008
129	NC_016591	GC	4	8	8339	8346	0 %	0 %	50 %	50 %	377807008
130	NC_016591	CGG	3	9	8378	8386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807008
131	NC_016591	TCG	3	9	8398	8406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807008
132	NC_016591	TGC	2	6	8416	8421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807008
133	NC_016591	CCG	2	6	8736	8741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807009
134	NC_016591	CG	3	6	8757	8762	0 %	0 %	50 %	50 %	377807009
135	NC_016591	GAC	2	6	8776	8781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807009
136	NC_016591	GCG	2	6	8782	8787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807009
137	NC_016591	GCGT	2	8	8802	8809	0 %	25 %	50 %	25 %	377807009
138	NC_016591	GCA	2	6	8811	8816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807009
139	NC_016591	AGC	2	6	8873	8878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807009
140	NC_016591	CCG	2	6	8906	8911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807009
141	NC_016591	AGA	2	6	8924	8929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807009
142	NC_016591	CTG	2	6	8938	8943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807009
143	NC_016591	GTG	2	6	8945	8950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807009
144	NC_016591	GC	3	6	8998	9003	0 %	0 %	50 %	50 %	377807009
145	NC_016591	ACG	2	6	9227	9232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807010
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147	NC_016591	GCGCCA	2	12	9329	9340	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	377807010
148	NC_016591	CG	3	6	9401	9406	0 %	0 %	50 %	50 %	377807010
149	NC_016591	AATCG	2	10	9757	9766	40 %	20 %	20 %	20 %	377807011
150	NC_016591	GCC	2	6	9776	9781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807011
151	NC_016591	GC	3	6	9783	9788	0 %	0 %	50 %	50 %	377807011
152	NC_016591	CCT	2	6	9795	9800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377807011
153	NC_016591	CGG	2	6	9930	9935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807011
154	NC_016591	CAC	2	6	9957	9962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807011
155	NC_016591	GCG	2	6	10073	10078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807011
156	NC_016591	CGT	2	6	10149	10154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807011
157	NC_016591	GC	3	6	10221	10226	0 %	0 %	50 %	50 %	377807011
158	NC_016591	CG	3	6	10241	10246	0 %	0 %	50 %	50 %	377807011
159	NC_016591	AGA	2	6	10276	10281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807011
160	NC_016591	GTG	2	6	10409	10414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807011
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163	NC_016591	TTC	2	6	10590	10595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807011
164	NC_016591	CCGC	2	8	10655	10662	0 %	0 %	25 %	75 %	377807011
165	NC_016591	CGC	2	6	10670	10675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807011
166	NC_016591	CGCC	2	8	10701	10708	0 %	0 %	25 %	75 %	377807011
167	NC_016591	GCA	2	6	10723	10728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807011
168	NC_016591	GCG	2	6	10774	10779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807011
169	NC_016591	TGC	2	6	10795	10800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807011
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171	NC_016591	AATC	2	8	10845	10852	50 %	25 %	0 %	25 %	377807011
172	NC_016591	GGCA	2	8	10867	10874	25 %	0 %	50 %	25 %	377807011
173	NC_016591	CGGATA	2	12	10908	10919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	377807011
174	NC_016591	AC	3	6	10974	10979	50 %	0 %	0 %	50 %	377807011
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176	NC_016591	CTG	2	6	11000	11005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807011
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183	NC_016591	CA	3	6	11383	11388	50 %	0 %	0 %	50 %	377807012
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197	NC_016591	TGA	2	6	12028	12033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807013
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202	NC_016591	GCCG	2	8	12808	12815	0 %	0 %	50 %	50 %	377807014
203	NC_016591	TCA	2	6	12873	12878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807014
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229	NC_016591	CGAT	2	8	13959	13966	25 %	25 %	25 %	25 %	377807014
230	NC_016591	GTT	2	6	13978	13983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377807014
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244	NC_016591	CAG	2	6	14809	14814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807016
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247	NC_016591	ACG	2	6	15657	15662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807017
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251	NC_016591	GAC	2	6	15848	15853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807017
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254	NC_016591	CGC	2	6	15987	15992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807017
255	NC_016591	GTG	2	6	16069	16074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807017
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257	NC_016591	GCC	2	6	16130	16135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807017
258	NC_016591	CGA	2	6	16186	16191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807017
259	NC_016591	GCA	2	6	16298	16303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807017
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261	NC_016591	AAG	2	6	16359	16364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807017
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390	NC_016591	GCTC	2	8	24289	24296	0 %	25 %	25 %	50 %	377807022
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